Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PHLDB1-218ENST00000530994 5945 ntTSL 218.72■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 263.6
UTP3Q9NQZ2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 263.6
UTP3Q9NQZ2 PHLDB1-214ENST00000528594 5787 ntTSL 218■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 263.6
UTP3Q9NQZ2 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 263.6
UTP3Q9NQZ2 STXBP1-214ENST00000635950 2771 ntTSL 522.07■■□□□ 1.126e-7■■■■■ 263.4
UTP3Q9NQZ2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.516e-7■■■■■ 263.4
UTP3Q9NQZ2 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.066e-7■■■■■ 263.4
UTP3Q9NQZ2 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.036e-7■■■■■ 263.4
UTP3Q9NQZ2 STXBP1-217ENST00000637060 3825 ntTSL 514.52□□□□□ -0.086e-7■■■■■ 263.4
UTP3Q9NQZ2 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.176e-7■■■■■ 263.4
UTP3Q9NQZ2 STXBP1-219ENST00000637464 4893 ntTSL 513.75□□□□□ -0.216e-7■■■■■ 263.4
UTP3Q9NQZ2 STXBP1-220ENST00000637521 2068 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.236e-7■■■■■ 263.4
UTP3Q9NQZ2 STXBP1-218ENST00000637173 4193 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 263.4
UTP3Q9NQZ2 STXBP1-215ENST00000636509 3949 ntTSL 511.93□□□□□ -0.56e-7■■■■■ 263.4
UTP3Q9NQZ2 STXBP1-209ENST00000626539 3840 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.526e-7■■■■■ 263.4
UTP3Q9NQZ2 STXBP1-208ENST00000626416 3700 ntTSL 57.03□□□□□ -1.286e-7■■■■■ 263.4
UTP3Q9NQZ2 CUX1-220ENST00000607092 559 ntTSL 36.71□□□□□ -1.347e-7■■■■■ 263.4
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-219ENST00000446818 3124 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 262.9
UTP3Q9NQZ2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.795e-8■■■■■ 262.6
UTP3Q9NQZ2 TACC1-219ENST00000522474 635 ntTSL 315.67■□□□□ 0.15e-8■■■■■ 262.6
UTP3Q9NQZ2 TACC1-225ENST00000522983 572 ntTSL 49.83□□□□□ -0.845e-8■■■■■ 262.6
UTP3Q9NQZ2 CALN1-205ENST00000431984 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 262.4
UTP3Q9NQZ2 CALN1-202ENST00000395275 9459 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 262.4
UTP3Q9NQZ2 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 262.4
UTP3Q9NQZ2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.294e-7■■■■■ 262.2
UTP3Q9NQZ2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 261
UTP3Q9NQZ2 NT5M-203ENST00000478373 771 ntTSL 333.93■■■■□ 3.027e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.417e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 915 ntTSL 1 (best)29.14■■■□□ 2.261e-30■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.227e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.183e-9■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.027e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 EMID1-207ENST00000435427 482 ntTSL 527.16■■□□□ 1.947e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 NT5M-202ENST00000470418 895 ntTSL 527.14■■□□□ 1.947e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.917e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.793e-6■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.747e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.747e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SIMC1-211ENST00000514128 697 ntTSL 225.84■■□□□ 1.737e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.72e-6■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.697e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.53■■□□□ 1.687e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.677e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.677e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.667e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.657e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CTDSP1-211ENST00000492545 634 ntTSL 525.05■■□□□ 1.67e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 MXI1-208ENST00000460667 782 ntTSL 324.99■■□□□ 1.592e-6■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SIMC1-210ENST00000508769 461 ntTSL 324.75■■□□□ 1.557e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.557e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 LRRC1-203ENST00000487251 2527 ntTSL 224.67■■□□□ 1.547e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 EMID1-204ENST00000429226 769 ntTSL 524.64■■□□□ 1.547e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.527e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CCDC28B-203ENST00000461819 780 ntTSL 524.48■■□□□ 1.517e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.517e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SIMC1-208ENST00000495423 913 ntTSL 224.35■■□□□ 1.497e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SIMC1-206ENST00000467472 364 ntTSL 524.35■■□□□ 1.497e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 BCL7A-202ENST00000432926 871 ntTSL 224.23■■□□□ 1.471e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.457e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.457e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 KLF11-203ENST00000440320 653 ntTSL 224.01■■□□□ 1.437e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.387e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.387e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.377e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.367e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.367e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.347e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.327e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 APOLD1-204ENST00000540583 574 ntTSL 423.16■■□□□ 1.37e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.287e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.267e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.267e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.243e-6■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.247e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TTLL11-204ENST00000474723 2699 ntTSL 222.71■■□□□ 1.237e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 VILL-206ENST00000463080 831 ntTSL 522.59■■□□□ 1.217e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 NEIL3-202ENST00000513321 1528 ntTSL 1 (best)22.57■■□□□ 1.27e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GGH-208ENST00000523788 492 ntTSL 222.54■■□□□ 1.27e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.52■■□□□ 1.27e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.177e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 EMID1-205ENST00000430127 641 ntTSL 522.32■■□□□ 1.167e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.167e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.157e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GHDC-205ENST00000585735 940 ntTSL 222.09■■□□□ 1.137e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TTLL11-206ENST00000487468 1038 ntTSL 1 (best)22.02■■□□□ 1.127e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 FGFR4-204ENST00000426612 712 ntTSL 1 (best)21.93■■□□□ 1.18e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.17e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.17e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.097e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.097e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.087e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.067e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.067e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 NUDT22-206ENST00000535000 1071 ntTSL 221.67■■□□□ 1.067e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SLC16A1-AS1-205ENST00000435800 1194 ntTSL 321.59■■□□□ 1.058e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.037e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.017e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.017e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.017e-11■■■■■ 260.8
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 485 ms