Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCLRE1BQ9H816 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCLRE1BQ9H816 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms