Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM15Q9C019 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM15Q9C019 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms