Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms