Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms