Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHANK2-AS3Q9BTD1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms