Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms