Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCT8L2Q96SF2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCT8L2Q96SF2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms