Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms