Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC10A4Q96EP9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms