Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35C1Q96A29 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35C1Q96A29 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35C1Q96A29 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35C1Q96A29 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35C1Q96A29 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35C1Q96A29 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35C1Q96A29 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35C1Q96A29 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35C1Q96A29 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35C1Q96A29 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35C1Q96A29 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35C1Q96A29 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35C1Q96A29 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35C1Q96A29 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35C1Q96A29 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 791.7 ms