Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAVIN3Q969G5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms