Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF13Q86YI8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms