Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMIM5Q71RC9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms