Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC149Q6ZUS6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms