Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAVIN1Q6NZI2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAVIN1Q6NZI2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAVIN1Q6NZI2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms