Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPECC1LQ69YQ0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms