Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCF4Q15080 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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