Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAM2Q15035 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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