Protein–RNA interactions for Protein: Q01081

U2AF1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1Q01081 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.357e-16■■■□□ 16
U2AF1Q01081 LUC7L-206ENST00000419516 1211 ntTSL 518.19■□□□□ 0.57e-16■■■□□ 16
U2AF1Q01081 LUC7L-217ENST00000490762 2643 ntTSL 1 (best)17.2■□□□□ 0.347e-16■■■□□ 16
U2AF1Q01081 LUC7L-210ENST00000430864 695 ntTSL 516.12■□□□□ 0.177e-16■■■□□ 16
U2AF1Q01081 LUC7L-205ENST00000418978 989 ntTSL 515.86■□□□□ 0.137e-16■■■□□ 16
U2AF1Q01081 LUC7L-208ENST00000428363 498 ntTSL 514.57□□□□□ -0.087e-16■■■□□ 16
U2AF1Q01081 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.125e-7■■■□□ 16
U2AF1Q01081 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.791e-6■■■□□ 16
U2AF1Q01081 RIT1-203ENST00000461050 803 ntTSL 517.6■□□□□ 0.411e-6■■■□□ 16
U2AF1Q01081 RIT1-202ENST00000368323 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.141e-6■■■□□ 16
U2AF1Q01081 RIT1-201ENST00000368322 855 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.651e-6■■■□□ 16
U2AF1Q01081 RIT1-206ENST00000609492 574 ntTSL 1 (best)9.75□□□□□ -0.851e-6■■■□□ 16
U2AF1Q01081 CD164-208ENST00000506649 778 ntTSL 328.38■■■□□ 2.131e-23■■■□□ 16
U2AF1Q01081 CD164-209ENST00000512212 590 ntTSL 219.13■□□□□ 0.651e-23■■■□□ 16
U2AF1Q01081 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.651e-23■■■□□ 16
U2AF1Q01081 CD164-204ENST00000413644 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.11e-23■■■□□ 16
U2AF1Q01081 CD164-202ENST00000310786 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.311e-23■■■□□ 16
U2AF1Q01081 CD164-201ENST00000275080 2954 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.531e-23■■■□□ 16
U2AF1Q01081 CD164-203ENST00000324953 2936 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.551e-23■■■□□ 16
U2AF1Q01081 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.21e-23■■■□□ 16
U2AF1Q01081 LUC7L3-205ENST00000504065 1071 ntTSL 56.52□□□□□ -1.371e-11■■■□□ 16
U2AF1Q01081 LUC7L3-219ENST00000511974 507 ntTSL 35.84□□□□□ -1.471e-11■■■□□ 16
U2AF1Q01081 LUC7L3-216ENST00000509487 647 ntTSL 34.43□□□□□ -1.71e-11■■■□□ 16
U2AF1Q01081 CD164-206ENST00000499860 2845 ntTSL 1 (best)2.45□□□□□ -2.021e-23■■■□□ 16
U2AF1Q01081 MBD6-204ENST00000547545 1884 ntTSL 1 (best)24.6■■□□□ 1.532e-9■■■□□ 16
U2AF1Q01081 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.082e-9■■■□□ 16
U2AF1Q01081 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.62e-9■■■□□ 16
U2AF1Q01081 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.332e-9■■■□□ 16
U2AF1Q01081 WDR27-209ENST00000486490 492 ntTSL 516.12■□□□□ 0.172e-7■■■□□ 16
U2AF1Q01081 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.572e-9■■■□□ 16
U2AF1Q01081 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.981e-323■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 SNHG14-214ENST00000551361 550 ntTSL 35.84□□□□□ -1.471e-6■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 LARP1-204ENST00000518297 2630 ntTSL 526.56■■□□□ 1.842e-7■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.32e-7■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 LARP1-215ENST00000524248 2128 ntTSL 520.47■□□□□ 0.872e-7■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 IVNS1ABP-204ENST00000459929 3657 ntTSL 516.97■□□□□ 0.312e-7■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.173e-6■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 TTK-208ENST00000509894 3725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.053e-6■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.042e-7■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 LARP1-213ENST00000523163 843 ntTSL 510.61□□□□□ -0.712e-7■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 LARP1-207ENST00000518742 587 ntTSL 59.07□□□□□ -0.962e-7■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 LARP1-205ENST00000518595 773 ntTSL 29.07□□□□□ -0.962e-7■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 FRRS1-204ENST00000492943 440 ntTSL 56.19□□□□□ -1.422e-7■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 FRRS1-203ENST00000489209 216 ntTSL 54.59□□□□□ -1.672e-7■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.943e-6■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 COG7-201ENST00000307149 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.195e-9■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 COG7-205ENST00000567821 922 ntTSL 513.9□□□□□ -0.185e-9■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.14e-8■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.014e-8■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 ARHGAP12-202ENST00000344936 4128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.14e-8■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.84e-8■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 ARHGAP12-210ENST00000497103 732 ntTSL 36.62□□□□□ -1.354e-8■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 ARHGAP12-206ENST00000454919 586 ntTSL 36.23□□□□□ -1.414e-8■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.714e-8■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 PTTG1IP-206ENST00000480234 398 ntTSL 327.11■■□□□ 1.932e-8■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.482e-8■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.472e-8■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.252e-8■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 PTTG1IP-207ENST00000494690 612 ntTSL 516.44■□□□□ 0.222e-8■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.411e-9■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 PIK3CB-206ENST00000469284 3164 ntTSL 56.61□□□□□ -1.358e-8■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.448e-8■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.942e-13■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.272e-13■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.092e-13■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.032e-13■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.252e-13■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 WNK1-211ENST00000540360 668 ntTSL 27.52□□□□□ -1.212e-13■■■□□ 15.9
U2AF1Q01081 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.377e-9■■■□□ 15.8
U2AF1Q01081 FASN-207ENST00000635197 627 ntTSL 321.25■□□□□ 0.992e-8■■■□□ 15.8
U2AF1Q01081 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.292e-8■■■□□ 15.8
U2AF1Q01081 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.252e-8■■■□□ 15.8
U2AF1Q01081 MSH5-SAPCD1-207ENST00000493662 3991 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.172e-10■■■□□ 15.8
U2AF1Q01081 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.737e-9■■■□□ 15.8
U2AF1Q01081 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.057e-9■■■□□ 15.8
U2AF1Q01081 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.992e-6■■■□□ 15.8
U2AF1Q01081 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.992e-6■■■□□ 15.8
U2AF1Q01081 KMT2C-212ENST00000558084 16862 ntTSL 1 (best)8.89□□□□□ -0.992e-6■■■□□ 15.8
U2AF1Q01081 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.427e-9■■■□□ 15.8
U2AF1Q01081 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.447e-9■■■□□ 15.8
U2AF1Q01081 UFD1-205ENST00000459854 5038 ntTSL 1 (best)11.81□□□□□ -0.527e-9■■■□□ 15.8
U2AF1Q01081 C4BPB-204ENST00000391923 949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.232e-11■■■□□ 15.7
U2AF1Q01081 C4BPB-205ENST00000452902 742 ntTSL 312.88□□□□□ -0.352e-11■■■□□ 15.7
U2AF1Q01081 C4BPB-203ENST00000367078 978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.472e-11■■■□□ 15.7
U2AF1Q01081 C4BPB-202ENST00000367076 1113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.482e-11■■■□□ 15.7
U2AF1Q01081 C4BPB-206ENST00000469326 1992 ntTSL 211.61□□□□□ -0.552e-11■■■□□ 15.7
U2AF1Q01081 C4BPB-201ENST00000243611 1117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-11■■■□□ 15.7
U2AF1Q01081 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.928e-9■■■□□ 15.7
U2AF1Q01081 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.333e-7■■■□□ 15.7
U2AF1Q01081 TNFRSF10B-207ENST00000523504 1464 ntTSL 228.91■■■□□ 2.223e-7■■■□□ 15.7
U2AF1Q01081 TNFRSF10B-201ENST00000276431 4146 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.083e-7■■■□□ 15.7
U2AF1Q01081 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.073e-9■■■□□ 15.7
U2AF1Q01081 MRPS21-202ENST00000614145 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.23e-9■■■□□ 15.7
U2AF1Q01081 CCDC162P-215ENST00000640771 4195 ntTSL 510.81□□□□□ -0.682e-6■■■□□ 15.7
U2AF1Q01081 CCDC162P-206ENST00000453496 2469 ntTSL 59.9□□□□□ -0.822e-6■■■□□ 15.7
U2AF1Q01081 ABCD3-206ENST00000493416 623 ntTSL 54.03□□□□□ -1.762e-13■■■□□ 15.7
U2AF1Q01081 HNRNPR-213ENST00000641107 646 nt20.19■□□□□ 0.821e-6■■■□□ 15.7
U2AF1Q01081 HNRNPR-206ENST00000464516 557 ntTSL 210.49□□□□□ -0.731e-6■■■□□ 15.7
U2AF1Q01081 FUBP1-212ENST00000492405 668 ntTSL 318.61■□□□□ 0.573e-7■■■□□ 15.7
U2AF1Q01081 FUBP1-213ENST00000492724 583 ntTSL 318.61■□□□□ 0.573e-7■■■□□ 15.7
Retrieved 100 of 10,096 protein–RNA pairs in 64.9 ms