Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PITPNAQ00169 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms