Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL38P63173 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL38P63173 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL38P63173 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL38P63173 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL38P63173 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL38P63173 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL38P63173 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL38P63173 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL38P63173 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL38P63173 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL38P63173 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL38P63173 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL38P63173 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL38P63173 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL38P63173 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL38P63173 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL38P63173 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL38P63173 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL38P63173 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL38P63173 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL38P63173 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL38P63173 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL38P63173 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL38P63173 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL38P63173 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL38P63173 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL38P63173 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL38P63173 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL38P63173 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL38P63173 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL38P63173 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL38P63173 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL38P63173 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL38P63173 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL38P63173 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL38P63173 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL38P63173 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL38P63173 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL38P63173 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL38P63173 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL38P63173 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL38P63173 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL38P63173 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL38P63173 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL38P63173 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL38P63173 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL38P63173 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL38P63173 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL38P63173 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL38P63173 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL38P63173 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL38P63173 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL38P63173 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL38P63173 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL38P63173 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL38P63173 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL38P63173 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL38P63173 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL38P63173 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL38P63173 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL38P63173 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL38P63173 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL38P63173 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL38P63173 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL38P63173 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL38P63173 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL38P63173 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL38P63173 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL38P63173 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL38P63173 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL38P63173 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL38P63173 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL38P63173 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL38P63173 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL38P63173 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL38P63173 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL38P63173 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL38P63173 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL38P63173 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL38P63173 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL38P63173 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL38P63173 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL38P63173 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL38P63173 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL38P63173 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL38P63173 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL38P63173 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL38P63173 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL38P63173 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL38P63173 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL38P63173 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL38P63173 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL38P63173 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL38P63173 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL38P63173 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL38P63173 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL38P63173 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL38P63173 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL38P63173 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms