Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2IP36954 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms