Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNNA2P26232 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA2P26232 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms