Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB1P11230 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB1P11230 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms