Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP1O94782 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP1O94782 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP1O94782 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP1O94782 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP1O94782 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP1O94782 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP1O94782 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP1O94782 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP1O94782 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP1O94782 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP1O94782 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP1O94782 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP1O94782 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP1O94782 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP1O94782 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP1O94782 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP1O94782 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP1O94782 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP1O94782 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP1O94782 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP1O94782 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP1O94782 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP1O94782 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP1O94782 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP1O94782 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP1O94782 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP1O94782 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP1O94782 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP1O94782 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP1O94782 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP1O94782 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP1O94782 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP1O94782 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP1O94782 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP1O94782 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP1O94782 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP1O94782 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP1O94782 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP1O94782 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP1O94782 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP1O94782 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP1O94782 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP1O94782 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP1O94782 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP1O94782 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP1O94782 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP1O94782 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP1O94782 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP1O94782 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP1O94782 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP1O94782 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP1O94782 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP1O94782 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP1O94782 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP1O94782 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP1O94782 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP1O94782 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP1O94782 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP1O94782 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP1O94782 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP1O94782 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP1O94782 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP1O94782 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP1O94782 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP1O94782 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP1O94782 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP1O94782 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP1O94782 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP1O94782 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP1O94782 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP1O94782 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP1O94782 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP1O94782 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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