Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPRY3O43610 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms