Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SGSM2O43147 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGSM2O43147 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SGSM2O43147 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGSM2O43147 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGSM2O43147 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGSM2O43147 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SGSM2O43147 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms