Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 ADGRE2-203ENST00000392962 1497 ntTSL 213.15□□□□□ -0.32e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SERPINF1-210ENST00000573770 789 ntTSL 312.94□□□□□ -0.342e-45■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.357e-16■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ADGRE2-209ENST00000596991 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.362e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 EHD2-201ENST00000263277 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.372e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ADGRE2-206ENST00000594294 2325 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.372e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 MTHFR-214ENST00000641747 3227 nt12.67□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 XRRA1-201ENST00000321448 4695 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 POC1B-203ENST00000539190 1727 ntTSL 512.37□□□□□ -0.431e-11■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 XRRA1-216ENST00000531852 690 ntTSL 312.19□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 PHYH-207ENST00000479604 642 ntTSL 311.81□□□□□ -0.521e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 MED9-203ENST00000581315 568 ntTSL 411.51□□□□□ -0.572e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SYK-201ENST00000375746 4990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.62e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 POC1B-205ENST00000546830 550 ntTSL 411.1□□□□□ -0.631e-11■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ADGRE2-202ENST00000360222 3330 ntTSL 211.01□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ZNF670-ZNF695-201ENST00000465049 1042 ntAPPRIS P5 TSL 510.85□□□□□ -0.672e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TUBA1A-204ENST00000547939 946 ntTSL 310.64□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ADGRE2-212ENST00000601345 3128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.782e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SYK-202ENST00000375747 4908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.792e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 POC1B-207ENST00000547496 1392 ntTSL 210.12□□□□□ -0.791e-11■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ADGRE2-201ENST00000315576 6767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.852e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TUBA1A-202ENST00000301071 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.862e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SDR39U1-207ENST00000553937 217 ntTSL 39.29□□□□□ -0.922e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 IQCH-AS1-203ENST00000559298 5753 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.962e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ZNF670-ZNF695-202ENST00000474541 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.972e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TUBA1A-205ENST00000548363 673 ntTSL 28.68□□□□□ -1.022e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 POC1B-208ENST00000548715 829 ntTSL 58.66□□□□□ -1.021e-11■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 POC1B-206ENST00000547274 473 ntTSL 38.5□□□□□ -1.051e-11■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TRDMT1-210ENST00000488990 1301 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.262e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 UFSP2-202ENST00000502282 367 ntTSL 56.65□□□□□ -1.342e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.351e-11■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 PIKFYVE-207ENST00000452564 4214 ntTSL 26.58□□□□□ -1.369e-11■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TRDMT1-212ENST00000525762 410 ntTSL 56.36□□□□□ -1.392e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TRDMT1-204ENST00000424636 333 ntTSL 55.91□□□□□ -1.462e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 OXR1-210ENST00000517686 564 ntTSL 45.64□□□□□ -1.512e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 PIKFYVE-205ENST00000422495 792 ntTSL 54.47□□□□□ -1.692e-10■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.72e-10■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TRDMT1-202ENST00000354631 8230 ntTSL 1 (best)4.41□□□□□ -1.72e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.872e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.942e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.952e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.982e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.072e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 AC135050.2-202ENST00000532364 499 ntTSL 421.72■■□□□ 1.077e-9■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.627e-9■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.617e-9■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.357e-9■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 VKORC1-206ENST00000420057 746 ntTSL 214.41□□□□□ -0.17e-9■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.57e-9■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 THAP12-203ENST00000528993 882 ntTSL 329.61■■■□□ 2.336e-8■■■■■ 37.7
DDX3XO00571 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.716e-8■■■■■ 37.7
DDX3XO00571 PQLC2-206ENST00000497827 1428 ntTSL 520.63■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 37.7
DDX3XO00571 VKORC1-208ENST00000498155 870 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.031e-14■■■■■ 37.7
DDX3XO00571 RHBDD2-207ENST00000468304 803 ntTSL 213.93□□□□□ -0.183e-20■■■■■ 37.7
DDX3XO00571 TPST1-204ENST00000480281 924 ntTSL 1 (best)24.38■■□□□ 1.493e-14■■■■■ 37.7
DDX3XO00571 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.263e-14■■■■■ 37.7
DDX3XO00571 TPST1-202ENST00000442120 560 ntTSL 422.19■■□□□ 1.143e-14■■■■■ 37.7
DDX3XO00571 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.098e-26■■■■■ 37.6
DDX3XO00571 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.988e-26■■■■■ 37.6
DDX3XO00571 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.588e-26■■■■■ 37.6
DDX3XO00571 TARDBP-225ENST00000621715 816 ntTSL 316.62■□□□□ 0.259e-31■■■■■ 37.6
DDX3XO00571 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.82e-9■■■■■ 37.6
DDX3XO00571 CTNNA1-231ENST00000521941 224 ntTSL 38.63□□□□□ -1.032e-13■■■■■ 37.6
DDX3XO00571 PKP3-206ENST00000528036 940 ntTSL 223.46■■□□□ 1.353e-24■■■■■ 37.6
DDX3XO00571 PKP3-210ENST00000533249 1111 ntTSL 322.84■■□□□ 1.253e-24■■■■■ 37.6
DDX3XO00571 PKP3-211ENST00000534401 756 ntTSL 322.07■■□□□ 1.123e-24■■■■■ 37.6
DDX3XO00571 PKP3-205ENST00000527442 847 ntTSL 321.95■■□□□ 1.13e-24■■■■■ 37.6
DDX3XO00571 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.73e-24■■■■■ 37.6
DDX3XO00571 PKP3-208ENST00000531857 687 ntTSL 417.14■□□□□ 0.333e-24■■■■■ 37.6
DDX3XO00571 PKP3-209ENST00000533069 590 ntTSL 217.02■□□□□ 0.323e-24■■■■■ 37.6
DDX3XO00571 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.242e-9■■■■■ 37.6
DDX3XO00571 SMIM19-208ENST00000529505 920 ntTSL 321.73■■□□□ 1.072e-9■■■■■ 37.6
DDX3XO00571 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.792e-9■■■■■ 37.6
DDX3XO00571 SMIM19-207ENST00000518574 233 ntTSL 318.87■□□□□ 0.612e-9■■■■■ 37.6
DDX3XO00571 SMIM19-206ENST00000498447 878 ntTSL 317.51■□□□□ 0.392e-9■■■■■ 37.6
DDX3XO00571 SMIM19-204ENST00000438528 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.772e-9■■■■■ 37.6
DDX3XO00571 LIFR-205ENST00000506990 760 ntTSL 321.15■□□□□ 0.981e-11■■■■■ 37.5
DDX3XO00571 LIFR-208ENST00000511561 574 ntTSL 420.31■□□□□ 0.841e-11■■■■■ 37.5
DDX3XO00571 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.451e-11■■■■■ 37.5
DDX3XO00571 LIFR-203ENST00000503088 2371 ntTSL 1 (best)7.41□□□□□ -1.221e-11■■■■■ 37.5
DDX3XO00571 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.031e-11■■■■■ 37.5
DDX3XO00571 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.348e-7■■■■■ 37.5
DDX3XO00571 EPS8-214ENST00000544064 577 ntTSL 422.42■■□□□ 1.181e-10■■■■■ 37.5
DDX3XO00571 EPS8-205ENST00000536793 559 ntTSL 418.53■□□□□ 0.561e-10■■■■■ 37.5
DDX3XO00571 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.361e-10■■■■■ 37.5
DDX3XO00571 EPS8-206ENST00000536956 621 ntTSL 316.38■□□□□ 0.211e-10■■■■■ 37.5
DDX3XO00571 EPS8-211ENST00000543468 3722 ntTSL 1 (best)13.43□□□□□ -0.261e-10■■■■■ 37.5
DDX3XO00571 EPS8-212ENST00000543523 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.371e-10■■■■■ 37.5
DDX3XO00571 EPS8-204ENST00000535752 543 ntTSL 44.43□□□□□ -1.71e-10■■■■■ 37.5
DDX3XO00571 C11orf24-204ENST00000529590 610 ntTSL 318.03■□□□□ 0.484e-11■■■■■ 37.5
DDX3XO00571 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.651e-16■■■■■ 37.4
DDX3XO00571 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.221e-6■■■■■ 37.4
DDX3XO00571 ZNF32-203ENST00000485351 471 ntTSL 28.85□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 37.4
DDX3XO00571 ATP5O-210ENST00000496044 673 ntTSL 217.58■□□□□ 0.48e-53■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 ATP5O-206ENST00000484627 157 ntTSL 1 (best)7.46□□□□□ -1.228e-53■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.431e-11■■■■■ 37.3
DDX3XO00571 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.361e-11■■■■■ 37.3
Retrieved 100 of 47,714 protein–RNA pairs in 1829.7 ms