Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC160A6NGH7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms