Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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IGHV3-16A0A0C4DH30 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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IGHV3-16A0A0C4DH30 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-16A0A0C4DH30 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-16A0A0C4DH30 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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