Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 STRN3-207ENST00000555358 2208 ntTSL 1 (best)22.49■■□□□ 1.192e-6■□□□□ 10
SF3B4Q15427 RUNX1-204ENST00000399237 822 ntTSL 519.3■□□□□ 0.687e-13■□□□□ 10
SF3B4Q15427 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.492e-6■□□□□ 10
SF3B4Q15427 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.227e-13■□□□□ 10
SF3B4Q15427 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.092e-6■□□□□ 10
SF3B4Q15427 ZNF330-208ENST00000515453 558 ntTSL 412.03□□□□□ -0.487e-13■□□□□ 10
SF3B4Q15427 ZNF330-207ENST00000514826 733 ntTSL 210.62□□□□□ -0.717e-13■□□□□ 10
SF3B4Q15427 AGO3-206ENST00000491443 548 ntTSL 210.22□□□□□ -0.776e-7■□□□□ 10
SF3B4Q15427 ANKRD10-204ENST00000463156 395 ntTSL 36.82□□□□□ -1.327e-13■□□□□ 10
SF3B4Q15427 RUNX1-210ENST00000467577 264 ntTSL 55.57□□□□□ -1.527e-13■□□□□ 10
SF3B4Q15427 STRN3-204ENST00000554124 785 ntTSL 43.69□□□□□ -1.822e-6■□□□□ 10
SF3B4Q15427 ANKRD10-205ENST00000464579 128 ntTSL 33.67□□□□□ -1.827e-13■□□□□ 10
SF3B4Q15427 ARHGEF12-205ENST00000526067 1323 ntTSL 37.59□□□□□ -1.191e-6■□□□□ 10
SF3B4Q15427 TARS-211ENST00000509410 782 ntTSL 33.65□□□□□ -1.833e-12■□□□□ 10
SF3B4Q15427 NCSTN-214ENST00000491390 592 ntTSL 310.04□□□□□ -0.83e-6■□□□□ 10
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SF3B4Q15427 AAAS-206ENST00000547238 1154 ntTSL 211.46□□□□□ -0.575e-7■□□□□ 10
SF3B4Q15427 AAAS-203ENST00000546393 832 ntTSL 510.2□□□□□ -0.785e-7■□□□□ 10
SF3B4Q15427 AAAS-207ENST00000547520 769 ntTSL 310.16□□□□□ -0.785e-7■□□□□ 10
SF3B4Q15427 AAAS-208ENST00000547757 949 ntTSL 29.19□□□□□ -0.945e-7■□□□□ 10
SF3B4Q15427 AAAS-209ENST00000547761 827 ntTSL 59.19□□□□□ -0.945e-7■□□□□ 10
SF3B4Q15427 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.055e-12■□□□□ 10
SF3B4Q15427 SERPINA3-201ENST00000393078 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.645e-12■□□□□ 10
SF3B4Q15427 SERPINA3-202ENST00000393080 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.725e-12■□□□□ 10
SF3B4Q15427 SERPINA3-208ENST00000556968 1289 ntTSL 1 (best)10.11□□□□□ -0.795e-12■□□□□ 10
SF3B4Q15427 SERPINA3-206ENST00000555820 981 ntTSL 59.34□□□□□ -0.915e-12■□□□□ 10
SF3B4Q15427 AL049839.2-201ENST00000553947 3067 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.955e-12■□□□□ 10
SF3B4Q15427 SERPINA3-207ENST00000556388 480 ntTSL 47.99□□□□□ -1.135e-12■□□□□ 10
SF3B4Q15427 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.63e-6■□□□□ 10
SF3B4Q15427 C1orf174-202ENST00000474140 3499 ntTSL 514.63□□□□□ -0.073e-6■□□□□ 10
SF3B4Q15427 C1orf174-203ENST00000486765 2517 ntTSL 512.29□□□□□ -0.443e-6■□□□□ 10
SF3B4Q15427 WDR60-204ENST00000454771 812 ntTSL 414.73□□□□□ -0.052e-11■□□□□ 10
SF3B4Q15427 IFRD1-210ENST00000462155 437 ntTSL 56.01□□□□□ -1.454e-9■□□□□ 10
SF3B4Q15427 SQLE-204ENST00000520493 737 ntTSL 33.93□□□□□ -1.785e-7■□□□□ 10
SF3B4Q15427 PRPF8-211ENST00000574728 466 ntTSL 24.17□□□□□ -1.741e-6■□□□□ 10
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SF3B4Q15427 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.062e-9■□□□□ 10
SF3B4Q15427 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.532e-9■□□□□ 10
SF3B4Q15427 GDA-202ENST00000358399 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-9■□□□□ 10
SF3B4Q15427 GDA-206ENST00000475764 2019 ntTSL 1 (best)9.54□□□□□ -0.882e-9■□□□□ 10
SF3B4Q15427 GDA-208ENST00000489618 888 ntTSL 39.12□□□□□ -0.952e-9■□□□□ 10
SF3B4Q15427 GDA-205ENST00000436438 990 ntTSL 38.78□□□□□ -12e-9■□□□□ 10
SF3B4Q15427 DYNC1H1-207ENST00000555800 474 ntTSL 28.78□□□□□ -12e-9■□□□□ 10
SF3B4Q15427 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.332e-9■□□□□ 10
SF3B4Q15427 DYNC1H1-202ENST00000553423 539 ntTSL 44.01□□□□□ -1.772e-9■□□□□ 10
SF3B4Q15427 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.65□□□□□ -1.833e-11■□□□□ 10
SF3B4Q15427 UCHL5-212ENST00000449480 784 ntTSL 34.97□□□□□ -1.613e-7■□□□□ 10
SF3B4Q15427 IL4R-214ENST00000565696 533 ntTSL 313.63□□□□□ -0.234e-9■□□□□ 10
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SF3B4Q15427 ARIH1-207ENST00000565950 559 ntTSL 46.95□□□□□ -1.32e-6■□□□□ 9.9
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SF3B4Q15427 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.261e-6■□□□□ 9.9
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SF3B4Q15427 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.141e-6■□□□□ 9.9
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SF3B4Q15427 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.58e-10■□□□□ 9.9
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SF3B4Q15427 TIMM17A-201ENST00000367287 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.871e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 TIMM17A-202ENST00000478378 821 ntTSL 36.19□□□□□ -1.421e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 PPP4R3B-201ENST00000470801 597 ntTSL 43.65□□□□□ -1.838e-10■□□□□ 9.9
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SF3B4Q15427 NSD2-221ENST00000511904 690 ntTSL 57.15□□□□□ -1.261e-13■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 KDELR1-202ENST00000594643 561 ntTSL 218.22■□□□□ 0.514e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 PLXNB2-211ENST00000492578 644 ntTSL 415.83■□□□□ 0.124e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.084e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.064e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 MRNIP-221ENST00000523267 741 ntTSL 314.82□□□□□ -0.044e-7■□□□□ 9.9
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SF3B4Q15427 MRNIP-215ENST00000521299 868 ntTSL 514.75□□□□□ -0.054e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.114e-7■□□□□ 9.9
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SF3B4Q15427 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.234e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 MRNIP-219ENST00000522663 2879 ntTSL 1 (best)11.98□□□□□ -0.494e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 MRNIP-206ENST00000518950 558 ntTSL 411.92□□□□□ -0.54e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 SFI1-213ENST00000463436 519 ntTSL 311.2□□□□□ -0.624e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 MRNIP-216ENST00000521333 410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.664e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 MRNIP-204ENST00000518219 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -14e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 NET1-204ENST00000465087 403 ntTSL 35.48□□□□□ -1.536e-25■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.232e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 TNFRSF10B-203ENST00000518531 564 ntTSL 314.35□□□□□ -0.112e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-255ENST00000637994 2468 ntTSL 516.67■□□□□ 0.262e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-225ENST00000635889 2260 ntTSL 516.66■□□□□ 0.262e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-234ENST00000636587 2040 ntTSL 515.98■□□□□ 0.152e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-227ENST00000635936 2223 ntTSL 515.97■□□□□ 0.152e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-222ENST00000635772 2768 ntTSL 515.81■□□□□ 0.122e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-254ENST00000637982 2330 ntTSL 515.66■□□□□ 0.12e-6■□□□□ 9.9
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SF3B4Q15427 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.072e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-252ENST00000637821 2026 ntTSL 515.46■□□□□ 0.072e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-240ENST00000636871 2076 ntTSL 515.4■□□□□ 0.062e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-251ENST00000637684 2168 ntTSL 515.37■□□□□ 0.052e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-244ENST00000637114 1991 ntTSL 515.25■□□□□ 0.032e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-248ENST00000637457 2815 ntTSL 515.15■□□□□ 0.022e-6■□□□□ 9.9
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