Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.737e-7■■■■■ 41.3
UTP3Q9NQZ2 SKP1-206ENST00000519321 692 ntTSL 324.13■■□□□ 1.454e-6■■■■■ 41.3
UTP3Q9NQZ2 SKP1-205ENST00000519054 654 ntTSL 37.31□□□□□ -1.244e-6■■■■■ 41.3
UTP3Q9NQZ2 CSNK1D-212ENST00000580061 578 ntTSL 317.09■□□□□ 0.336e-7■■■■■ 41.2
UTP3Q9NQZ2 PRRC2B-205ENST00000451855 1762 ntTSL 523.45■■□□□ 1.341e-6■■■■■ 41.2
UTP3Q9NQZ2 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 41.2
UTP3Q9NQZ2 SETD5-201ENST00000302463 4786 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 41.2
UTP3Q9NQZ2 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 41.2
UTP3Q9NQZ2 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 41.2
UTP3Q9NQZ2 SETD5-228ENST00000493918 4861 ntTSL 1 (best)7.67□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 41.2
UTP3Q9NQZ2 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 41.2
UTP3Q9NQZ2 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 41.2
UTP3Q9NQZ2 RER1-208ENST00000493207 686 ntTSL 218.1■□□□□ 0.495e-7■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.555e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.375e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.115e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.025e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.85e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.755e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 STK25-228ENST00000487962 2024 ntTSL 218.73■□□□□ 0.595e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.23■□□□□ 0.515e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 STK25-208ENST00000423004 773 ntTSL 216.4■□□□□ 0.225e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.045e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 RBM14-RBM4-204ENST00000511114 523 ntTSL 413.09□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 ENOSF1-215ENST00000583771 436 ntTSL 524.52■■□□□ 1.522e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 ENOSF1-218ENST00000584453 1230 ntTSL 524.33■■□□□ 1.492e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.072e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 ENOSF1-211ENST00000581475 1745 ntTSL 1 (best)19.45■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 ENOSF1-206ENST00000578651 1177 ntTSL 218.88■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 ENOSF1-222ENST00000585128 1296 ntTSL 513.86□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 ENOSF1-221ENST00000585004 1501 ntTSL 210.52□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 41.1
UTP3Q9NQZ2 SRRT-209ENST00000474896 726 ntTSL 316.47■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 41
UTP3Q9NQZ2 PICALM-215ENST00000531558 565 ntTSL 527.58■■■□□ 2.012e-6■■■■■ 41
UTP3Q9NQZ2 PICALM-218ENST00000532041 699 ntTSL 324.58■■□□□ 1.532e-6■■■■■ 41
UTP3Q9NQZ2 KANSL1-221ENST00000638902 1971 ntTSL 214□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 41
UTP3Q9NQZ2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.232e-8■■■■■ 41
UTP3Q9NQZ2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.012e-8■■■■■ 41
UTP3Q9NQZ2 CTSB-210ENST00000526195 560 ntTSL 417.25■□□□□ 0.351e-8■■■■■ 41
UTP3Q9NQZ2 CTSB-208ENST00000525076 550 ntTSL 516.05■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 41
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UTP3Q9NQZ2 MAF1-206ENST00000534811 632 ntTSL 214.94□□□□□ -0.022e-8■■■■■ 41
UTP3Q9NQZ2 FAM13A-204ENST00000502914 587 ntTSL 48.17□□□□□ -1.12e-8■■■■■ 41
UTP3Q9NQZ2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 41
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UTP3Q9NQZ2 TPT1-AS1-220ENST00000524062 2285 ntTSL 217.72■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 41
UTP3Q9NQZ2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 41
UTP3Q9NQZ2 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 41
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UTP3Q9NQZ2 TPT1-AS1-205ENST00000517509 3456 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 41
UTP3Q9NQZ2 XPO6-205ENST00000564337 605 ntTSL 513.05□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 41
UTP3Q9NQZ2 XPO6-204ENST00000563138 562 ntTSL 212.26□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 41
UTP3Q9NQZ2 XPO6-212ENST00000567842 588 ntTSL 511.14□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 41
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UTP3Q9NQZ2 BCCIP-204ENST00000463330 500 ntTSL 36.14□□□□□ -1.431e-12■■■■■ 41
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UTP3Q9NQZ2 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.612e-7■■■■■ 41
UTP3Q9NQZ2 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.189e-7■■■■■ 41
UTP3Q9NQZ2 NOP53-202ENST00000594182 303 ntTSL 315.73■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 41
UTP3Q9NQZ2 LUC7L-220ENST00000495349 1006 ntTSL 214.61□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 41
UTP3Q9NQZ2 FAM229A-203ENST00000428500 362 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.78■□□□□ 0.66e-11■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 CHD2-221ENST00000635856 4236 ntTSL 57.28□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.114e-7■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.214e-7■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 MATR3-201ENST00000394805 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.874e-7■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.194e-7■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.264e-7■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 HNRNPC-227ENST00000556897 1252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.883e-9■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 FASN-213ENST00000637693 100 ntTSL 510.4□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 SCAF11-206ENST00000474828 757 ntTSL 218.02■□□□□ 0.485e-7■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 NELFA-211ENST00000458616 792 ntTSL 317.69■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.175e-7■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 LIG1-215ENST00000597901 565 ntTSL 416.02■□□□□ 0.168e-9■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.125e-7■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 SCAF11-209ENST00000547018 3271 ntTSL 514.19□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 SCAF11-201ENST00000266589 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.52□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 SCAF11-202ENST00000369367 7543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.555e-7■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 USP8-216ENST00000561206 556 ntTSL 28.08□□□□□ -1.121e-9■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.51e-9■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.511e-9■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.541e-9■■■■■ 40.9
UTP3Q9NQZ2 ANKRD12-206ENST00000577992 390 ntTSL 324.33■■□□□ 1.492e-7■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 TAF1-202ENST00000373775 2199 ntTSL 510.14□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 TAF1-205ENST00000437147 2295 ntTSL 1 (best)10□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 SLC6A8-203ENST00000429147 334 ntTSL 217.89■□□□□ 0.451e-15■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 UBE3C-207ENST00000494532 543 ntTSL 215.19■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 40.8
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