Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX13Q9Y5W8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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SNX13Q9Y5W8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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SNX13Q9Y5W8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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SNX13Q9Y5W8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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SNX13Q9Y5W8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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SNX13Q9Y5W8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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SNX13Q9Y5W8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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SNX13Q9Y5W8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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