Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms