Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HCN4Q9Y3Q4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms