Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC3Q9UQE7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms