Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
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TMOD4Q9NZQ9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
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TMOD4Q9NZQ9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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TMOD4Q9NZQ9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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TMOD4Q9NZQ9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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TMOD4Q9NZQ9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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TMOD4Q9NZQ9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
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TMOD4Q9NZQ9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMOD4Q9NZQ9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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