Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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