Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED29Q9NX70 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms