Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC39A9Q9NUM3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms