Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF275Q9NSD4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF275Q9NSD4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms