Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMMDC1Q9NPL8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMMDC1Q9NPL8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms