Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUFT1Q9NNX1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms