Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MIXL1Q9H2W2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MIXL1Q9H2W2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms