Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL4Q9C0H6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL4Q9C0H6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms