Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms