Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms