Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELQQ8TDG4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELQQ8TDG4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms