Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF4

CCDC190, Coiled-coil domain-containing protein 190, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC190Q86UF4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC190Q86UF4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms